Научно-исследовательские подразделения:
Отдел генетики популяций и природопользования науч. рук. - д.б.н. Д.В. Политов
Лаборатория популяционной генетики зав. - д.б.н. Д.В. Политов
Лаборатория генетики человека зав. - д.б.н. О.В. Жукова
Группа популяционной иммуногенетики рук. - д.б.н. И.Г. Удина
Группа генетической адаптации человека рук. - д.б.н. К.Б. Булаева
Отдел генетики животных науч. рук. - д.б.н., проф. Г.Е. Сулимова
Лаборатория сравнительной генетики животных зав. - д.б.н., проф. Г.Е. Сулимова
Группа генетики насекомых зав. – к.б.н. Б.В. Андрианов
Отдел генетики растений науч. рук. – д.б.н. А.М. Кудрявцев
Лаборатория генетики растений зав. – д.б.н. А.М. Кудрявцев
Группа молекулярно-генетических основ иммунитета растений зав. – д.б.н. Т.И. Одинцова
Испытательная лаборатория науч. рук. – д.б.н. А.А. Поморцев
Отдел генетической безопасности науч. рук. - д.б.н. А.В. Рубанович
Лаборатория экологической генетики зав. - д.б.н. А.В. Рубанович
Группа мутагенеза и репараций рук. - к.б.н. И.М. Васильева
Отдел геномики и генетики человека науч. рук. - д.б.н., проф. Е.И. Рогаев
Лаборатория анализа генома зав. - член-корр. РАН Н.К. Янковский
Лаборатория эволюционной геномики зав. - д.б.н., проф. Е.И. Рогаев
Лаборатория цитогенетики зав. - д.б.н., доц. О.Л. Коломиец
Группа геномики растений зав. - д.б.н. И.В. Голденкова-Павлова
Отдел генетических основ биотехнологии науч. рук. - д.б.н., проф. В.Н. Даниленко
Лаборатория генетики микроорганизмов зав.- д.б.н., проф. В.Н. Даниленко
Лаборатория генетических основ биоразнообразия зав. - д.б.н. Д.В. Муха
Лаборатория функциональной геномики зав. - к.б.н. С.А. Брускин
Отдел эпигенетики науч. рук. - д.б.н., проф. С.Л. Киселев
Лаборатория генетических основ клеточных технологий зав. - д.б.н. М.А. Лагарькова
Группа эпигенетики человека и животных рук. – к.б.н. П. К. Головатенко-Абрамов
Отдел вычислительной системной биологии науч. рук. - д.б.н. В.Ю. Макеев
Лаборатория системной биологии и вычислительной генетики зав. - д.б.н. В.Ю. Макеев
Группа биоинформатики рук. – к.б.н. И.И. Артамонова
Отдельные подразделения
Лаборатория генетических проблем идентификации зав. - д.б.н., проф. Л.А. Животовский
Группа геномной географии рук. - к.б.н. О.П. Балановский
Группа советников при дирекции
Научно-вспомогательные подразделения
ЦКП ОБН РАН "Генетический полиморфизм" науч. рук. - д.б.н. Д.В. Ребриков
Мемориальный музей-кабинет Н.И. Вавилова н.с. Т.Б. Авруцкая
Мемориальный музей-кабинет акад. Н.П. Дубинина в.н.с., к.б.н. Л.Г. Дубинина
Учебно-научный центр науч. рук. - д.б.н., проф. С.К. Абилев
Отдел аспирантуры рук. - к.б.н. Т.А. Синельщикова
Научный совет по проблемам генетики и селекции
Отдел по международным научным связям
Участок по обслуживанию лабораторных животных (виварий)
Научный стационар (отдел) "Горки Ленинские" рук. - В.А. Жидкова
Научный стационар (отдел) "Обухово" рук. - А.И. Шестеркина
Санкт-Петербургский филиал ИОГен РАН
директор филиала – академик РАН С.Г. Инге-Вечтомов
Административно-управленческий персонал филиала
Лаборатория генетики и биотехнологии растений зав. - д.б.н. А.В. Войлоков
Лаборатория генетического моделирования болезней человека зав. - к.б.н. А.П. Галкин

